Еркин Ботаканов стал заместителем главы МВД – главнокомандующим Нацгвардией. С августа 1990 года по март 2006 года проходил службу в Республиканской гвардии на должностях от командира роты до командира полка. Много позже, с июля 2010 года по июль 2013 года – был первым заместителем главнокомандующего внутренними войсками – начальником главного штаба – заместитель председателя Комитета внутренних войск МВД. С июля 2014 года по август 2020 года – командующий региональным командованием “Орталық” Национальной гвардии. С 7 августа 2020 года занимал пост первого заместителя главнокомандующего Национальной гвардией – начальника главного штаба.